Gromacs 教學


練習題
  • 去/fileserver-alpha/wayne841002/teach/longbox找到test_2018-07-31_12-08，複製到自己家​
  • 從test_2018-07-31_12-08找資訊計算出水在300K下時的surfacetension。​(提示 : 利用gromacs手冊找出計算surfacetension的公式​)
  • 利用g_energy指令製作出一份含有Pxx, Pyy, Pzz 資訊的.xvg檔​

  • 去/home/wayne841002/teach/example 把 2bulk 複製到自己家​
  • 把submit.sh裡面路徑改成自己想存的路徑，並把模擬第3步「 –maxwarn 1 」這幾個字刪除，然後去執行模擬​
  • 我想這樣會出錯，去查看err檔找出為何會出錯​
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Ċ
gromacs教學(柏偉).pdf
(1260k)
謝孟廷,
Jul 17, 2019, 10:35 PM
v.2